Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpbP27790 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CenpbP27790 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpbP27790 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpbP27790 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CenpbP27790 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpbP27790 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpbP27790 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms