Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde6aP27664 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde6aP27664 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6aP27664 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6aP27664 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6aP27664 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pde6aP27664 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pde6aP27664 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6aP27664 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6aP27664 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6aP27664 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde6aP27664 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde6aP27664 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms