Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgfb2P27090 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb2P27090 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms