Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd247P24161 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd247P24161 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd247P24161 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd247P24161 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms