Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxd11P23813 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd11P23813 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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