Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfyaP23708 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfyaP23708 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfyaP23708 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms