Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja1P23242 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja1P23242 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja1P23242 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja1P23242 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gja1P23242 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms