Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RarbP22605 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RarbP22605 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RarbP22605 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RarbP22605 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RarbP22605 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RarbP22605 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RarbP22605 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RarbP22605 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RarbP22605 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RarbP22605 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RarbP22605 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RarbP22605 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RarbP22605 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RarbP22605 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RarbP22605 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RarbP22605 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RarbP22605 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RarbP22605 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RarbP22605 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RarbP22605 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RarbP22605 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RarbP22605 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RarbP22605 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RarbP22605 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RarbP22605 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RarbP22605 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RarbP22605 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RarbP22605 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RarbP22605 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RarbP22605 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RarbP22605 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms