Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou3f1P21952 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms