Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prim1P20664 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim1P20664 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prim1P20664 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim1P20664 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim1P20664 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prim1P20664 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prim1P20664 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms