Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcaP20444 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms