Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfaP20033 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms