Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trap1aP19473 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trap1aP19473 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms