Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifrd1P19182 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms