Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnc1P19123 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms