Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18530 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18530 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18530 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18530 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18530 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18530 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18530 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18530 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18530 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18530 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18530 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18530 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P18530 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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