Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18529 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18529 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18529 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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P18529 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18529 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18529 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms