Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18526 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18526 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18526 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18526 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18526 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18526 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18526 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18526 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18526 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18526 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18526 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18526 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18526 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18526 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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