Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18525 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18525 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18525 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18525 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18525 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18525 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18525 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18525 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18525 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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