Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsdP18242 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsdP18242 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsdP18242 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsdP18242 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtsdP18242 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtsdP18242 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtsdP18242 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtsdP18242 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtsdP18242 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsdP18242 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsdP18242 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsdP18242 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms