Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb1P17919 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms