Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms