Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgfb3P17125 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms