Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms