Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme1P15532 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme1P15532 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme1P15532 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms