Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnmt1P13864 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnmt1P13864 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dnmt1P13864 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms