Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd5P13379 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd5P13379 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd5P13379 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd5P13379 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms