Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb1P12658 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb1P12658 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb1P12658 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Calb1P12658 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Calb1P12658 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms