Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga5P11688 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga5P11688 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.5 ms