Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd1d1P11609 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd1d1P11609 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms