Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DmdP11531 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DmdP11531 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DmdP11531 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DmdP11531 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DmdP11531 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DmdP11531 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DmdP11531 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DmdP11531 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DmdP11531 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DmdP11531 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DmdP11531 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DmdP11531 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DmdP11531 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DmdP11531 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DmdP11531 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DmdP11531 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DmdP11531 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DmdP11531 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DmdP11531 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DmdP11531 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DmdP11531 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DmdP11531 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DmdP11531 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DmdP11531 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DmdP11531 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DmdP11531 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DmdP11531 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DmdP11531 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DmdP11531 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DmdP11531 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DmdP11531 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DmdP11531 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DmdP11531 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DmdP11531 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DmdP11531 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DmdP11531 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DmdP11531 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DmdP11531 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DmdP11531 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DmdP11531 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DmdP11531 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DmdP11531 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DmdP11531 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DmdP11531 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DmdP11531 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DmdP11531 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DmdP11531 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms