Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms