Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Myod1P10085 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Myod1P10085 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms