Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6c1P0CW02 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms