Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UbbP0CG49 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms