Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LtaP09225 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LtaP09225 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtaP09225 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LtaP09225 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtaP09225 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LtaP09225 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LtaP09225 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LtaP09225 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtaP09225 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtaP09225 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtaP09225 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtaP09225 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LtaP09225 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LtaP09225 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LtaP09225 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LtaP09225 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LtaP09225 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LtaP09225 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtaP09225 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LtaP09225 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtaP09225 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtaP09225 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LtaP09225 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtaP09225 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtaP09225 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtaP09225 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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