Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeflP08551 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeflP08551 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeflP08551 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NeflP08551 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NeflP08551 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NeflP08551 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NeflP08551 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NeflP08551 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NeflP08551 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NeflP08551 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NeflP08551 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NeflP08551 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NeflP08551 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NeflP08551 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NeflP08551 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NeflP08551 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeflP08551 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeflP08551 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeflP08551 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeflP08551 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeflP08551 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeflP08551 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeflP08551 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeflP08551 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeflP08551 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeflP08551 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeflP08551 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeflP08551 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeflP08551 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NeflP08551 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms