Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TnfP06804 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TnfP06804 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TnfP06804 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TnfP06804 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TnfP06804 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TnfP06804 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TnfP06804 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TnfP06804 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TnfP06804 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TnfP06804 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TnfP06804 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TnfP06804 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TnfP06804 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TnfP06804 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TnfP06804 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms