Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JunP05627 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JunP05627 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JunP05627 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JunP05627 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JunP05627 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JunP05627 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JunP05627 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
JunP05627 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
JunP05627 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JunP05627 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JunP05627 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JunP05627 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JunP05627 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
JunP05627 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JunP05627 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
JunP05627 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
JunP05627 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms