Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04212 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04212 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P04212 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P04212 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P04212 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P04212 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P04212 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P04212 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P04212 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P04212 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P04212 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P04212 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P04212 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms