Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01679 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01679 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01679 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01679 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01679 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01679 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01679 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01679 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01679 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01679 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01679 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01679 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01679 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01679 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01679 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01679 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01679 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01679 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01679 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01679 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01679 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01679 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01679 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01679 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01679 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01679 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01679 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01679 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01679 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01679 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01679 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01679 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01679 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01679 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01679 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01679 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01679 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01679 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01679 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01679 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms