Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01658 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01658 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01658 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01658 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01658 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01658 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01658 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01658 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01658 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01658 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01658 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01658 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01658 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01658 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01658 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01658 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01658 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01658 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01658 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01658 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms