Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01636 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01636 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01636 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01636 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01636 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01636 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01636 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01636 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01636 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01636 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01636 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01636 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01636 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01636 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01636 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01636 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01636 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01636 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01636 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01636 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms