Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna1P01572 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms