Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcn2O88968 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcn2O88968 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms