Protein–RNA interactions for Protein: O88951

Lin7b, Protein lin-7 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7bO88951 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin7bO88951 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms