Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
F11rO88792 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
F11rO88792 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F11rO88792 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F11rO88792 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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