Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnmt3bO88509 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms