Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3aO88508 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3aO88508 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms