Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CntfrO88507 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CntfrO88507 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CntfrO88507 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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